(puede ser
- lo que más le interesó,
- lo que resultó ser novedoso,
- lo que causó un cambio de punto de vista sobre algo ya conocido, etc
(sobre lo que le gustaría aprender/expander más de lo que ya vimos en clase, en lecturas, en ejercicios, etc, )
3. Cumplió con sus expectativas de esta parte?
Por favor escriba las respuestas en un comentario aqui con su nombre y titulo de la clase(s) y fecha.
Gracias!
1. Al momento de colocar landmarks es arbitrario el colocarlos como tales o como semilandmarks, lo cual depende de las características morfométricas que queremos analizar de la estructura en cuestión (e.g. la curvatura del opérculo o el inicio de la misma!!!).
ResponderEliminarEs común cometer el error de cooplanaje y coplanaridad al momento de colocar los landmarks o semilandmarks, por lo cual considero es necesario tener en cuenta digitalizar los especímenes en elmismo plano, ya que estamos trabajando con estructuras 3d las cuales son proyectadas en 2d al momento de digitalizar los especímenes.
2. En los landmarks existe algún intervalo de confianza para el error al momento de colocarlas? Esto es interesante dado que los resultados y conclusiones están en función de la precisión al momento de asignar dichos puntos.
Que es mejor utilizar abanicos o peines? existe alguna diferencia entre ambas estrategias de análisis para la colocación de semilandmarks?
3. me parece muy buena idea el empezar el curso hablando de definiciones y problemas al momento de digitalizar y colocar puntos homologos, ya que asi estamos seguros de que hablamos en los mismos terminos y eliminamos el error debido a la digitalizacion u colocacion de marcas.
La colocacion de marcas o semimarcas no debe ser asi. Por un lado las marcas existen en la imagen, son reales biologicamente. Las semimarcas no existen, son creads por la interseccion de lineas con un contorno.
Eliminar1.-Pues aprendí de todo porque vengo en blanco, lo que más me interesó fue el punto de discutir el porque tampoco la MG tiene qe ser lo máximo.
ResponderEliminar2.- me gustaría aprender más de estadistica e incluso el porque usar los terminos o conceptos que se usan, como mencioné antes, se muy poco. También me hubiera gustado hablar un poquito más sobre la toma de las fotografías o que tan practico sería usar un escaner.
3.- Si, un poco rapido en la cuestion del por qué usar tal o tal cosa en estadistica, pero pq me falta saber un poco mas.
La idea del programa en este curso es presuponer que YA saben estadistica. Por la natualeza intensiva, una semana, no es posible convertir este curso en un curso de Estadistica. Sorry.
EliminarElizabeth Nava
ResponderEliminartítulo: introducción, hipótesis y métodos de registro.
En relación a la pregunta uno, los tres puntos vistos hoy se me hicieron muy importantes ya que me aclararon muchas dudas, en particular con los métodos de registro y con los errores que se pueden cometer al realizar la toma de fotografías. Ya que consideraba que en la rotación, translación y en el escalamiento se eliminaba toda la variación que se tenía de las fotografías.
2. Me gustaría ampliar un poco más en el tema de hipótesis, ya que ¿ quisiera saber sobre como aplicar el modelo normal y a nuestros datos y que pruebas estadísticas son las convenientes para ellos?
3. Claro que sí se cumplió la primera parte que vimos hoy y aclare muchas dudas y aprendí otras.
Si la rotacion, translacion y escalaminteo elimina toda la variacion, eso quiere decir que todas las estructuras tienen la misma forma.
EliminarInquietudes que me han surgido se refieren al porque consideran el Análisis de Componentes Principales como un método no estadístico.
ResponderEliminarMe interesa entender como calcular la asimetría de estructuras.
Jimena Bohórquez
Lo de los ACP sera evidente unas cuantas clases mas. No es estadistico en el sentido de que no hay pruebas de significancia ni particion de varianzas por grupos o factores. Los ACP son metodos exploratorios.
EliminarUlianov Jakes Cota
ResponderEliminar27-02-2012
1. Me sorprendió conocer que la morfometría geométrica no es más exacta que la morfometría tradicional, al igual que las coordenadas tienen más error que las distancias. El segundo punto fué conocer que los métodos estadísticos se aplican en la morfometría tradicional y no directamente en la morfometría geométrica...
2. Tengo la curiosidad de sabes si una vez que se tomaron distancias sobre una estructura dura y no se obtuvieron imágenes, es decir las medidas se hicieron directamente sobre las estructuras duras, existe alguna técnica para convertir esas distancias en coordenadas y aplicar métodos morfométricos para su análisis...?
3. Cumplió ampliamente con mis expectativas...
1. Me gusto el panorama general de la morfometría que fue mostrado en esta sesión introductoria, así como el refuerzo de conceptos básicos necesarios para abordar las situaciones más complejas (precisión, exactitud, etc.)
ResponderEliminar2. En lo personal me gustaría conocer algo de detalle de los principal/relative warps.
3. Si
27/feb/2012
Hector Villalobos
Itzi Fragoso Martínez
ResponderEliminarClase 1
1. ¿Cuales son los dos puntos más importantes que aprendió Ud. esta mañana?
-Lo que causó que cambiara mi punto de vista fue enterarme de que los datos originales son los peores que pueden ser utilizados y la importancia de la rotación de los mismos.
-Lo que más me interesó fue la diferencia e importancia de la precisión y la exactitud.
2. Plantee una pregunta
Me gustaría ver más información sobre las características de las fotos a utilizar en la digitalización de marcas. Tal vez sugerencias para llevar a cabo esta fase, pues como soy nueva en la MG todavía desconozco los pparámetros que deben tomarse para producir fotografías útiles.
3. Cumplió con sus expectativas de esta parte?
si
1.- El metodo de registro.
ResponderEliminar2.- me gustaria aprender un poco mas de como seleccionar los puntos dentro de una organismo. los criterios mas importantes ha tomar en cuenta.
3.- el lenguaje y la dinamica del curso me parecieron interesantes.
1.-
ResponderEliminara.- muy interesante e importante la explicación de los posibles errores previos a la toma de datos (coplanaridad)
b.- me gusto el concepto de disperción y exactitud
c.- la importancia y la distribucion de probabilidades del pixel
2.- todos los espacios no euclidianos se llaman rhimenianos ? o es uno en particular
3.- si me gusto esta parte solo creo que es importante ser mas explicito entres las diferencias entre los diferentes tipos de lanmarks en particular la 2 y la 3 de repente me daba la sensación de que eran iguales. creo que hubo varias dudas en esa parte, por que fue la parte que mas tardo en pasar y mas preguntas surgieron.
Francisco J. Vergara.
clase 1
lo que mas me gusto fue la explicación de la diferencia entre precisión y exactitud.
ResponderEliminarCuales son los tipos de analisis estadisticos que se aplican en morfometria y como elegir el optipo.
Hasta al momento a cumplido con mis expectativas el curso.
Jacob Rubio
Lo que mas me intereso fue la morofmetria como una herramienta para estudiar la forma de los organismos y que esta no precisamente sea lo maximo ya que se puede complementar con otros estudios. algo que resulto novedoso fue lo de los programas de imp los cuales aun no se manejar pero espero poder hacerlo al termino del curso.
ResponderEliminarMe gustaria saber mas sobre los semilandmarks sobre lo que comentaba mi compañera jimena.
veronica rivera
Jasmín Granados Amores
ResponderEliminarLa parte de los errores en cuanto las fotografías, considero que fue lo más importante para mí. Ya que es la parte importante para que los análisis sean más precisos. Por otro lado considero que la parte estadística y los conceptos que nos explicaron aclararon algunas dudas que tenía en cuanto a estos temas.
J. Armando Medina E.
ResponderEliminar1- eliminar muestras que se encuentran dañadas es recomendable, a tratar de realizar una configuración que no es del todo confiable.
la manera en la que pueden descomponerse las configuraciones para ser analizadas en dado caso que falten algunos puntos o marcas (Landmarks). lo que resulto un cambio en mi punto de vista aún y cuando desconozco mucho del tema fue lo relacionado a los armonicos de fourier.
2- me gustaría se hablara un poco más de tecnicas o análisis para hacer morfometría en 3-D, eso se me hace interesante.
3- el curso me parece bien, creo que conforme vayan pasando las clases todo va a ir quedando mucho mas claro,
Me ayudó a entender los pasos a seguir y en que casos se puede aplicar la morfometría geométrica, además me aclaró la diferencia entre landmarks y semi. Por la parte de los modelos multivariados ahora se en que casos no se debe utilizar y me ayudó a diferenciar entre precisión y exactitud.
ResponderEliminarMe gustaría aprender más acerca de qué estadísticos puedo utilizar aparte de los modelos multivariados.
Si cumplió mis espectativas esta parte porque no estaba relacionada con los términos, conceptos y sobre todo las aplicaciones.
Hortensia Santillán
1.- En la introducción me intereso mucho el protocolo que se debe plantear y desarrollar para abordar alguna pregunta científica con análisis de MG.
ResponderEliminarAlgo novedoso fue el hecho de saber el uso de datos originales no es bueno.
Los conceptos de básicos de precisión, exactitud, lo diferentes tipos de landmarks y la características que tiene que cumplir para ser un (landmark) es bastante interesante así como reconocer los tipos de errores (EF, ED y coplanaridad)
2. Un poco más de tiempo en explicar cómo tomar las fotos y los errores que se pueden tener si se hace mal, o mandar un archivo con algunas recomendaciones para antes del curso.
3. Cumplió bien con mis expectativas, excepto por la parte de la toma de imágenes.
Atentamente Alejandro Marín
1.- Novedoso e interesante del primer tema fue la manera de plantear las preguntas iniciales de cualquier investigación (Cuantas formas tengo y la segunda cual es el cambio entre las formas detectadas). En el segundo tema me resulto muy importante la forma de evitar los errores.
ResponderEliminar2. Me gustaria aprender un poco más sobre los ortonormalizado, y sobre la manera de tomar fotografias (la distancia a la que debe estar la camara por ejemplo)
Y como es que se combinan los Landmark con los semilandmark no me queod muy claro.
Si la primera parte de este curso me parecio muy adecuado
Jatziry
27 de Febrero de 2012
ResponderEliminarEntre los puntos importantes destaco el de las fotografias, debido a que para poder realizar un buen análisis de morfometría geométrica, se debe contar con fotografías de calidad, si no, desde ese momento se genera un error muy grande, además de que los datos originales no son los más adecuados como se nos había dicho en otros comentarios.
Respecto a las dudas que me quedaron, me gustaría saber si se pueden emplear únicamente semi-landmarks sin emplear landmarks?
Att. Jessica A. Navarro González
Introducción:
ResponderEliminarBueno, hasta el momento esta muy interesante el curso, aprendí que debo tener mucho cuidado en la toma de mis imágenes, de la calidad de ellas depende todo mi trabajo, así como que el no variar el equipo donde realice las landmarks es de gran importancia, bueno todo lo visto es importante, pero quizá no reparamos en que algo tan sencillo como es esta cuestión técnica pueda causar tanto efecto en nuestro trabajo final.
En cuanto a las dudas, por el momento creo que no tengo, más bien ahora que lo ponga en practica creo que es cuando empiezan a generarse.
El curso para mi va perfecto, cubriendo las expectativas.
Nombre?
Eliminara por cierto yo sugeriria que para no perder tanto tiempo en la mañana pongan antes las extensiones y el equipo antes d que empieze la clase.
ResponderEliminarVeronica Rivera
1- Aprendi sobre los Tipos de Landmarks y utilidad de semi-landmarks. Desconocia la importancia de utilizar un solo monitor de buena resolucion para la toma de landmarks.
ResponderEliminar2- Un poco más ejemplos de semi-landmarks
3- Si
David Paz
*las dos cosas mas importantes que aprendí hoy...
ResponderEliminar1.- que la MG no es la octava maravilla, no tiene todas las respuestas y no es la unica alternativa... En algun otro cursillo que tomé se habló algo despectivo acerca de la Morfometria tradicional y creí que tenía más problemas que ventajas...
2.- ESTADISTICA... en este ratito entendi (más o menos...me hace falta acabar de masticarlos!!) muchos conceptos que me confundían...
* Si. esta parte cumplió bien con las expectativas... si bien yo esperaba algo asi como una serie de pasos a seguir....aprendi que no existen los pasos..solo hay ideas generales..
att
Josefina Ramos Frías
27-febrero de -2012
La pregunta a responder es qué tan relacionada está la ontogenía con la forma en las diferentes familias de rayas.
ResponderEliminarY lo que he más me ha interesado hoy es que un punto de vista puede cambiar la interpretación de nuestros análisis. Es decir, que podamos contestar la pregunta inicial independientemente de lo que vayamos usando en el camino, por eso es necesario un buen diseño de muestreo!!!
Nombre?
EliminarClase de introducción, hipótesis y registro.
ResponderEliminar27 de febrero del 2012
Adriana Martínez Guevara
De manera general, el curso se me esta haciendo más interesante de lo que de por si ya me parecía. En lo personal la MG es algo novedoso para mí, aun cuando es algo con lo que se trabaja en forma en la colección ictiológica del CICIMAR-IPN.
Dentro de este contexto:
1.- Lo que me pareció más interesante fue que, si estoy en lo correcto, la mayoría del sesgo y el error en este tipo de metodologías esta determinada en las imágenes de los objetos de estudio, en mi caso los peces. Anteriormente tomaba las fotografías de manera no tan "concienzuda", ahora se que es muy importante tomar en cuenta la resolución, los pixeles, la precisión y exactitud de todos los elementos derivados.
2.- En la digitalización, como discernir o como establecer si un punto es un landmark o semilandmark?....
3.- Esta parte del programa superó mis expectativas. Gracias y en espera de las clases de mañana.
Saludos
Miguel
ResponderEliminar1. Las características de las landmarks y las fuentes de error, así como los conceptos de exactitud y precisión.
2. Manejo de imágenes
3. Si
Griselma Rubio Castro
ResponderEliminarIntroducciòn (27-febrero-2012)
1.- Conocía la morfometría geométrica solo por asistencia a presentaciones en seminarios y congresos. Lo que mas me interesó fueron sus principales aplicaciones, los puntos que se deben de tomar en cuenta antes de elegir los landmarks y los pasos que se deben seguir para realizar esta metodología.
2. ¿Como saber que estructura se puede utilizar para llevar a cabo morfometría? Aunque no es el objetivo de mi tesis, me interesa hacer un ensayo utilizando espinas de peces de pico (pez vela).
3. Esta parte del curso cumplió con mis expectativas, solo que me parece muy poco el tiempo dedicado en la practica con los programas.
Raúl Lara
ResponderEliminarAprendí de como agregarles los semilandmark a los otolitos de peces y quehacer en caso de que un otolito, estructura o ejemplar este incompleto, es necesario incuiro para que corra el programa y despues de eso quitar esas imágenes. Más vale no meter esas imagenes que intuir en donde se encuentran las estructuras incompletas.
¿Que pasa cuando tengo imagenes de la misma estructura de diferente tamaño, se tiene que calbrar al final o sólo se maneja por proporciones?
"en caso de que un otolito, estructura o ejemplar este incompleto, es necesario incuiro para que corra el programa y despues de eso quitar esas imágenes." ...NO! Lo que Efrain quiso decir fue: no se incluye desde el principio.
EliminarTenía planteadas algunas preguntas sobre mis organismos antes de empezar este curso, por ejemplo: cómo puedo determinar la variación morfométrica entre 7 especies de rayas del mismo género, si a ojo yo sé que son mínimas. Ahora tengo la misma pregunta como muchas otras, pero ya con un enfoque distinto para tratar de responderlas.
ResponderEliminarCuando nos presentan algo por primera vez o nos resulta interesante o de plano ni nos importa, en mi caso con este curso considero que me ha despertado un gran interés, que no es tan fácil como pensaba. Mi interés es aún mayor, porque aunque la parte de análisis genéticos no están comprometidos con mi tema de investigación en el doctorado, si los vamos a trabajar por separado, entonces complementar la morfometría geométrica con los análisis genéticos me parece que nos podrá dar buenos resultados. Lo nuevo para el diccionario personal: Asimetría fluctuante!. Tenía algunas dudas con las fotografías que afortunadamente ya se resolvieron ayer. ¿ Cuándo sabe usted las fechas tentativas para la recepción de resúmenes del congre de agosto?